El muestreo de alcantarillado ya está siendo monitoreado por Covid. ¿Qué más puede encontrar?

Hay suficientes esfuerzos para detectar las aguas residuales de Covid ahora que el CDC es nuevo marcador contiene datos de 471 puntos de análisis, incluidos los sistemas de alcantarillado municipal, las instalaciones universitarias de tratamiento de agua y los laboratorios de investigadores académicos. "Los CDC están apoyando a 37 estados, cuatro ciudades y dos territorios para ayudar a desarrollar sistemas de monitoreo de aguas residuales en sus comunidades", dijo Amy Kirby, líder del equipo del Sistema Nacional de Monitoreo de Aguas Residuales. rueda de prensa anuncio del sistema. "El poder real de este programa será más evidente en las próximas semanas, cuando cientos de sitios de prueba más comiencen a enviar datos".

Esto puede sonar exhaustivo, pero como reveló la analista Betsy Ladijec en su boletín Enviar datos de Covid-19casi la mitad de ellos son agrupados en tres estados: Red de Johnson en Missouri, además de Ohio y Wisconsin. Otros siete estados (California, Colorado, Nueva York, Carolina del Norte, Texas, Utah y Virginia) tienen suficientes sitios de muestreo para proporcionar una imagen utilizable del movimiento del virus en sus territorios. Pero la mayoría de los estados no los tienen, y 18 no tienen ningún sitio de análisis de aguas residuales. "Si bien el nuevo rastreador de aguas residuales de los CDC ofrece una imagen decente de las tendencias nacionales de Covid-19", escribió, "generalmente es inútil para los datos locales en la mayoría de los estados".

Estas brechas de datos son una advertencia de dónde la respuesta de Covid aún es ciega, pero también son una oportunidad. Son lugares donde se pueden instalar sistemas de detección de bajo costo y bajo esfuerzo, diseñados desde el principio para el informe de los mismos conjuntos de datos, en las instalaciones de aguas residuales existentes para construir una red cohesiva Construir la detección de aguas residuales es uno de los objetivos del nuevo Instituto para la Prevención de Pandemias de la Fundación Rockefeller, que tiene como objetivo conectar diferentes flujos de datos en redes de descubrimiento global.

"Lo hemos visto hacer aquí en Ghana, en Bangladesh, en toda la India, en la Administración de Seguridad de la Salud del Reino Unido", dijo Samuel Scarpino, director gerente del Instituto de Vigilancia de Patógenos y una rama de la Universidad del Noreste. uno reúne toda esta información, la superpone con genomas clínicos, la superpone con datos epidemiológicos y trata de ver el panorama general. Esta es la pieza que se cose, que sigue siendo la brecha más grande".

Sin embargo, la verdadera promesa del monitoreo de aguas residuales es lo que los sistemas de detección pueden proporcionar una vez que puedan expandirse más allá de los muertos de seguimiento de Covid. mcr find sugiere cómo las empresas de servicios públicos pueden rastrear las bacterias resistentes a los antibióticos. Algunas ciudades, como houston y Tulsay algunas empresas privadas, como biobotseparados del Instituto de Tecnología de Massachusetts, han comenzado a escanear las aguas residuales de la gripe, buscando pistas sobre la llegada de la temporada de gripe y midiendo potencialmente su intensidad. En última instancia, los investigadores esperan que el análisis de aguas residuales pueda proporcionar información sobre la aparición de patógenos hasta ahora desconocidos, incluidos aquellos que parecen ser candidatos para futuras pandemias.

Nuevo trabajo del equipo de CUNY muestra una mirada temprana a esta posibilidad, al tiempo que revela las dificultades que implica identificar el significado de la señal aberrante. Durante un año, el grupo descubrió lo que llaman “nuevas criptomonedas del SARS-CoV-2”, variaciones del virus que no existen en las bases de datos internacionales compartidas donde se registran los resultados de la secuenciación. "No solo no se han visto en ninguna parte de Nueva York o Estados Unidos, sino que nunca se han visto en ensayos clínicos en ninguna parte del mundo", dijo Denehy. Se encuentran solo en aguas residuales: indicios irritantes de algunas cepas desconocidas, cuyo origen no podemos determinar en este momento ".

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